A Study on the Synthesis, Crystallographic Structure, DFT Calculations, Hirshfeld Surface Analysis, Drug-likeness and Molecular Docking of the Julolidene-Based Schiff Base Containing Compound
Yazarlar (4)
Dr. Öğr. Üyesi Seher MERAL Sinop Üniversitesi, Türkiye
Prof. Dr. Cem Cüneyt ERSANLI Sinop Üniversitesi, Türkiye
Doç. Dr. Zeynep KELEŞOĞLU Sinop Üniversitesi, Türkiye
Prof. Dr. Ayşen Alaman Ağar Ondokuz Mayıs Üniversitesi, Türkiye
Makale Türü Açık Erişim Özgün Makale (Diğer hakemli uluslarası dergilerde yayınlanan tam makale)
Dergi Adı Sinop Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi
Dergi ISSN 2536-4383
Dergi Tarandığı Indeksler TR DİZİN
Makale Dili İngilizce Basım Tarihi 06-2025
Cilt / Sayı / Sayfa 10 / 1 / 165–187 DOI 10.33484/sinopfbd.1664284
Makale Linki https://doi.org/10.33484/sinopfbd.1664284
UAK Araştırma Alanları
Yoğun Madde Fiziği
Özet
Bu çalışma, juloliden bazlı bir molekülün (C36H50N4O2) moleküler yapısının derinlemesine bir incelemesini sunmaktadır. Araştırma X-ışını kırınımı, yoğunluk fonksiyonel teorisi hesaplamaları, Hirshfeld yüzey analizi, ilaç benzerliği değerlendirmesi ve moleküler yerleştirme simülasyonlarını içermektedir. Bileşiğin yapısı ilk olarak X-ışını koordinatlarından türetilmiş ve daha sonra 6-31G(d,p) ve 6-311G(d,p) temel setleri ile B3LYP yoğunluk fonksiyonel teorisi yöntemi kullanılarak optimize edilmiştir. Bu makalede, bu molekülün ayrıntılı moleküler etkileşimleri ve X-ışını kristal yapısı tartışılmaktadır. Uzay grubu 𝑃1̅ ve aşağıdaki birim hücre parametrelerine sahiptir: a = 6.8512 (9) Å, b = 9.9748 (14) Å, c = 13.892(3) Å, α = 74.679 (13)o, β = 86.608 (13)o, γ = 75.049 (11)o, V = 884.6 (2) Å3, Z = 1. Juloliden bazlı bileşik, ters simetriye sahip asimetrik birimdeki molekülün sadece yarısı ile kristalize edilmiştir. O–H···N ve C–H···O hidrojen bağları ve C–H···π etkileşimlerinden oluşan karmaşık bir ağ, kristal yapıyı stabilize ederek supramoleküler mimariler oluşturur. Sentezlenen bileşiğin teorik parametreleri deneysel bulgularla karşılaştırılmıştır. Optimize edilmiş yapı, sınır moleküler orbital analizi, moleküler elektrostatik potansiyel ve kimyasal reaktivite indekslerini kapsayan aynı teorik düzeyde analiz edilmiştir. Moleküler etkileşimleri tahmin etmek için Hirshfeld yüzey değerlendirmesi kullanılmıştır. Buna ek olarak, ilaç benzerliği çalışması şema üzerinde gerçekleştirilmiştir.
Anahtar Kelimeler
Hirshfeld yüzey analizi | X-ışını | Juloliden | DFT çalışmaları | ilaç-benzerliği | moleküler kenetlenme analizi